循环水杀菌灭藻剂的选择根据不同的水质、细菌的种类，特别是pH值。当pH值较高时，不宜用氯气等氧化性杀菌剂，而季铵盐类杀菌剂pH值越高越好。当水中含有Fe2＋和H2S时，不宜运用氧化性杀菌剂，否则不只会添加氧化性杀菌剂用量，而且影响污水处理的水质。与其它水处理剂配伍，不能产生反应互相抵消其作用。具有杰出的溶解性，参加后不影响水质参加后，不能添加水中的胶体颗粒数，能均匀溶解水中，且清澈透明。同一污水处理系统应间隔选用不同种类的杀菌剂，防止细菌产生抗药性高效低毒，易降解，无环境污染。

    循环水杀菌灭藻剂的添加：

    1、投加办法：接连投加，操控细菌数量的添加。

    2、间歇冲击投加：大剂量投加杀灭许多细菌。

    3、两者结合。加药点一般设在污水处理系统的远端，如进站来水处（除油罐前）。为保证灌水水质，一般在污水处理的滤后或灌水泵进口设加药点。

    加药量：接连式投加，初步浓度较高 ，细菌数量操控下来后，选用相对较低的加药浓度。有用浓度由室内点评和现场细菌分析供认。

    间歇冲击投加：守时运用较高浓度的。

    循环水杀菌灭藻剂通过污水处理系统灭菌。加药周期、加药量、加药时刻，根据室内点评和现场细菌分析而定，通过现场实践进行调整。细菌数量监控水处理系统参加杀菌剂后，要守时取样，按惯例办法进行细菌计数，随时调整加药办法和加药浓度，保证杀菌剂杀菌作用。